Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm2A2A7B5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm2A2A7B5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms