Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms