Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk1bQ9Z2C6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms