Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms