Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nubp2Q9R061 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nubp2Q9R061 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nubp2Q9R061 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nubp2Q9R061 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nubp2Q9R061 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nubp2Q9R061 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nubp2Q9R061 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nubp2Q9R061 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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