Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rabgef1Q9JM13 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rabgef1Q9JM13 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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