Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL16

Isg20, Interferon-stimulated gene 20 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isg20Q9JL16 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Isg20Q9JL16 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Isg20Q9JL16 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms