Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ap4m1Q9JKC7 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192 ms