Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trim2Q9ESN6 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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