Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms