Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms