Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Hmg20aQ9DC33 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Hmg20aQ9DC33 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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