Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms