Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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