Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Derl3Q9D8K3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms