Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cldn22Q9D7U6 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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