Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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Trappc6bQ9D289 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Trappc6bQ9D289 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Trappc6bQ9D289 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Trappc6bQ9D289 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Trappc6bQ9D289 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Trappc6bQ9D289 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Trappc6bQ9D289 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Trappc6bQ9D289 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Trappc6bQ9D289 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
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