Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Smurf1Q9CUN6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smurf1Q9CUN6 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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