Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms