Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
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Ercc8Q8CFD5 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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Ercc8Q8CFD5 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
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Ercc8Q8CFD5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Ercc8Q8CFD5 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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