Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms