Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rdh13Q8CEE7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rdh13Q8CEE7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms