Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CntrobQ8CB62 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CntrobQ8CB62 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms