Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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