Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rft1Q8C3B8 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rft1Q8C3B8 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rft1Q8C3B8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rft1Q8C3B8 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Rft1Q8C3B8 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rft1Q8C3B8 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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