Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Pon1-203ENSMUST00000176945 619 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Olfr444-202ENSMUST00000204092 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Ido1-201ENSMUST00000033956 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trim35Q8C006 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trim35Q8C006 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm45817-201ENSMUST00000212738 1757 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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