Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tnfsfm13Q8BXS2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Tnfsfm13Q8BXS2 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tnfsfm13Q8BXS2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tnfsfm13Q8BXS2 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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