Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl16Q8BSU2 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl16Q8BSU2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms