Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NischQ80TM9 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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