Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Dsg1bQ7TSF1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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