Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms