Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shq1Q7TMX5 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms