Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Tmeff1Q6PFE7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Tmeff1Q6PFE7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Tmeff1Q6PFE7 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Tmeff1Q6PFE7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Tmeff1Q6PFE7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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