Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nop58Q6DFW4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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