Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
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Ccdc18Q640L5 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Ccdc18Q640L5 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ccdc18Q640L5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ccdc18Q640L5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ccdc18Q640L5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ccdc18Q640L5 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Ccdc18Q640L5 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc18Q640L5 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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