Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms