Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BB287469Q3UT53 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BB287469Q3UT53 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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