Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm28047Q3US59 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm28047Q3US59 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm28047Q3US59 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm28047Q3US59 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm28047Q3US59 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm28047Q3US59 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm28047Q3US59 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm28047Q3US59 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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