Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Srsf6Q3TWW8 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms