Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Treml4Q3LRV9 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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