Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms