Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rundc1Q0VDN7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms