Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MestQ07646 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MestQ07646 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MestQ07646 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MestQ07646 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MestQ07646 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MestQ07646 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MestQ07646 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MestQ07646 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MestQ07646 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MestQ07646 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MestQ07646 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MestQ07646 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms