Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cntn3Q07409 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms