Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Siah1bQ06985 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms