Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gjb2Q00977 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms