Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Stx2Q00262 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms