Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gabpb2P81069 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gabpb2P81069 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gabpb2P81069 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gabpb2P81069 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gabpb2P81069 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gabpb2P81069 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gabpb2P81069 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms