Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Irx1P81068 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Irx1P81068 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Irx1P81068 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms