Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Hoxd13P70217 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxd13P70217 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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